甲硫醇是最常見的惡臭物質，具有易燃易爆、高毒、高腐蝕性等特性的酸性氣體，常溫下為氣體，易揮發，無色，易液化氣體或水白色液濃臭味。由于甲硫醇屬于硫醇有機物中相對分子質量最小的, 非常活潑, 易與其它物質反應構成含硫物質,是合成農藥、醫藥、食品和合成材料等主要原料。因而甲硫醇的用途較為廣泛：

農藥方面

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在農藥方面, 甲硫醇是合成除草劑西草凈、殺蟲劑滅多威、倍硫磷等的重要中間體。

倍硫磷

倍硫磷是對人、畜低毒的有機磷殺蟲劑, 對多種害蟲有效, 主要起觸殺和胃毒作用, 殘效期長, 主要用于大豆食心蟲、棉花害蟲、果樹害蟲、蔬菜和水稻害蟲, 用于防治蚊、蠅、臭蟲、蟑螂也有良好效果。甲硫醇被過氧化氫氧化生成二甲基二硫, 再與間甲酚作用生成對甲硫基間甲酚, 在NaOH作用下, 與 O,O- 二甲基硫代磷酰氯反應得到倍硫磷。

西草凈

西草凈是一種選擇性內吸傳導型除草劑, 主要用于稻田防除稗草、牛毛草、眼子菜、澤瀉、野慈菇、母草、小慈草等, 它與殺草丹、丁草胺混用, 可擴大其殺譜，也可用于玉米、大豆、花生、棉花等。西草凈是由甲硫醇提供甲硫基與乙胺、三聚氯氰在氫氧化鈉作用下合成而成。

滅多威

滅多威為一種內吸性具有觸殺、胃毒作用的廣譜殺蟲劑, 適用于棉花、煙草、果樹、蔬菜防治蚜蟲、蛾、地老虎等害蟲, 是目前防治抗藥性棉蚜良好的替代品種。在滅多威的合成中使用甲硫醇主要是提供甲硫基,形成含硫殺蟲劑。另外,甲硫醇還可作為合成克線磷、涕滅威等農藥的中間體。

醫藥方面

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在維生素的合成中甲硫醇是主要的一個中間體; 甲硫醇又是合成防紫外線輻射劑的最佳中間體。甲硫醇可以和重金屬鹽如汞、鉛、銻、銅、銀鹽作用,生成不溶于水的重金屬鹽沉淀, 因而可作為重金屬的解毒劑。它也是氨基酸輸液, 復合氨基酸的主要組分之一; 還可利用其具有抗脂肪肝的作用, 用作保肝制劑目前, 在醫藥行業中甲硫醇的使用正在廣泛的研究、開發。

食品添加劑方面

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甲硫醇可以作為飼料添加劑、嗅味劑以及蛋氨酸的主要原料。如蛋氨酸是最重要的氨基酸之一, 是唯一含硫醚的氨基酸, 是飼料工業、醫藥工業、保健產品及食品業廣泛應用的原料, 作為強化飼料的營養劑, 彌補氨基酸平衡的飼料添加劑。以丙烯醛和甲硫醇為原料、在甲酸及乙酸銅存在下縮合生產 3-甲硫基丙醛, 將其與氰化鈉和碳酸氫銨溶液混合, 加熱到 90 ℃, 反應得到甲硫乙基內酰脲,不需分離和提純, 即可與 28 %的氫氧化鈉溶液加熱至 180℃, 水解生成蛋氨酸鈉, 再用鹽酸中和得到成品蛋氨酸。

其它用途

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甲硫醇經過氯氧化可以制備甲基磺酰氯, 甲基磺酰氯與具有活潑氫的化合物極易反應,可用來與氨基、羥基反應, 引入甲基磺酰基。甲基磺酰氯可用于鄰苯二甲酰甘酸甲酯化的催化劑、芳香族叔胺與丙烯腈共聚的催化劑、液態 SO2的穩定劑、干性油印刷油墨、涂料的快速固化劑; 此外, 還可作為由烯丙醇合成烯丙基過氧化物, 聚酯的染色改良劑, 彩色照片的調色劑; 還用于二甲苯與甲醛的縮合, 羊毛染色助劑, 以及作為醫藥、農藥的原料。甲基磺酰氯經水解又可制得甲基磺酸, 甲基磺酸屬有機強酸, 可作為酯化催化劑, 醫藥原料, 以及電鍍液的添加劑、穩定劑。橡膠工業中甲硫醇作為硫化劑使用。由于甲硫醇有毒并且具有惡臭, 空氣中含有五億分之一 (體積) 即可嗅出, 因此在煤氣、天然氣、石油、液化氣中加入少量的甲硫醇, 作為賦嗅劑, 以便在泄漏時能及時發現, 避免中毒。另外, 在航天行業中也有應用。